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유전체 정보분석 전문가 기본과정 I

Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼
다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의
중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.
서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의
맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계
package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 12일
간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정I 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다.

일 시 : 2022년 7월 4일(월) ~ 2022년 7월 19일(화)                    

■ 일정별 프로그램

• 교육대상:
  
  (1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
  (2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
  (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자
  
  
• 지원절차:
  
  서류 전형 및 합격자 개별 통지
  원서교부 및 접수기간 : 2022.6.15 ~ 2022.6.23
  제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
       본 강의는 현장강의로 진행합니다.
  사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
  홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course9.html
  지원방법 : 이메일 제출(우편 접수 불가)
  합격자 발표일시 : 2022.6.28 (예정)
  
  

지원서 다운로드(한글)
지원서 다운로드(워드)

요로감염증 (UTI)

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요로감염증 (UTI; Urinary Tract Infection)

: 소변이 만들어져서 내려오는 우리 몸의 모든 기관 즉 콩팥, 요관, 방광, 요도에 생긴 감염을 통칭

1) 상부요로감염(upper tract UTI)
-소변을 만드는 콩팥(신장)과 소변이 방광으로 이동하는 통로인 요관에 생기는 감염
-신우신염(pyelonephritis), 신장농양(renal abscess)

2) 하부요로감염(lower tract UTI)
-소변을 모아 놓았다가 한꺼번에 배출하는 방광과 소변이 몸 밖으로 배출되는 통로인 요도에 생긴 감염
-요도염(urethritis), 방광염(cystitis), 전립선염(prostatitis)

요로감염 증상

1) 상부요로감염 : 전신적인 증상이 생길 수 있으며, 배뇨와 관련된 증상은 없는 경우도 있음
-발열, 오한
-측복부 통증(또는 옆구리 통증), 허리 통증
-두통
-메스꺼움, 구토, 복통

2) 하부요로감염 : 배뇨와 관련된 증상이 생길 수 있으나, 전신적인 증상은 나타나지 않음
-치골 위 불쾌감: 아랫배나 하부 골반의 뻐근한 통증
-배뇨통: 소변을 볼 때 통증이나 작열감이 발생하는 증상
-빈뇨: 소변을 자주 보게 되는 증상
-급뇨(급박뇨): 소변을 참기 어렵고 급하게 소변을 봐야 하는 증상
-잔뇨감: 소변을 보고 나서도 시원하지 않고 묵직하게 느껴지는 증상
-야뇨(야간뇨): 밤에 자다가 일어나 소변을 봐야 하는 증상
-탁뇨: 탁한 색깔의 소변을 보는 것
-혈뇨: 소변에 피가 섞여 나오는 것

요로감염 병태생리

: 요로감염의 가장 흔한 원인균은 대장균

: 인체는 요도 점막을 제외한 요로계의 점막에 세균이 달라붙지 못하도록 하는 방어기전을 갖고 있음

: 또한 정상적인 소변이나, 전립선 분비물은 세균의 증식을 억제함

: 이러한 방어기전에 이상이 생길 때 요로감염 발생 가능성이 높아짐

#Reference

1) Harrison’s Principles of Internal Medicine, 20th Edition

2) 질병관리청 질환정보 - 요로감염

3) Descriptive Epidemiology of Acute Pyelonephritis in Korea, 2010–2014: Population-based Study J Korean Med Sci. 2018 Dec 3;33(49):e310
4) 요로감염 항생제 사용지침 2018 질병관리본부
5) 감염학 개정판 2014 대한감염학회

요로감염증 (UTI)

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한국유전체학회 통계워크샵 홈페이지

한국생명공학연구원 채용홈페이지

국립암센터 연구소 정규직 연구직 채용공고

1. 모집내용

※ 연구직 연구원급은 별도의 승진 없음

[공통응시자격]

2. 전형절차

※ 우리기관 관련 내규에 의거, 응시 분야 및 응시인원에 따라 [관심대상자추천위원회]는 생략 할 수 있음

[전형단계별 평가내용]

3. 전형일정

◯ 책임/선임연구원

※ 상기 일정은 일정에 따라 다소 변경 될 수 있음

◯ 연구원

※ 상기 일정은 일정에 따라 다소 변경 될 수 있음

4. 지원서 접수 및 제출서류

○ 국립암센터 채용 사이트에 온라인 접수(http://ncc.recruiter.co.kr)

○ 접수기간 : 2022 5. 31.(화) ∼ 2022. 6. 14.(화) 17시까지

○ 제출서류

1. 온라인 응시원서

※ 블라인드 채용 안내

2. SCIE급 저널에 교신저자 또는 제1저자로 게재한 논문의 PDF 파일 각 1부

(온라인 지원서 내 첨부)

※ 논문 파일 등록 시 저자의 성명 및 소속은 블라인드 처리

3. 논문, 저서 및 특허 등 총괄업적표

(온라인 지원서 내 첨부된 엑셀을 작성후 업로딩)

4. 추천서(동일분야 전공자 2명 이상의 개별 추천서) 각 1부

※ 추천서 관련 안내 사항

<최종합격자에 한해 제출>

­ 학력(졸업예정증명서 또는 졸업증명서) 및 성적증명서(대학 및 대학원) 각 1부

­ 경력증명서 또는 재직증명서(해당자에 한함) 각 1부

※ 지원서에 작성한 모든 경력의 증빙 제출 필요

­ 국가유공자 및 유족입증서류(해당자에 한함)

­ 장애인 입증서류(해당자에 한함)

­ 어학성적증명서, 전산자격증 사본(해당자에 한함)

5. 우대사항

6. 기 타

○ 이 공고에 명시되지 않은 사항은 국립암센터 인사관련 규정 등에 의함

○ 해당분야에 적격자가 없을 경우 선발하지 않을 수도 있음

○ 합격 후 응모자격 및 지원서 등에 기재된 내용이 사실과 상이하거나 면허취득 등

자격조건에 미달하는 경우 및 임용에 결격사유가 확인되는 경우는 합격을 취소함

○ 최초임용계약은 2년을 체결하며 이후 재계약임용 심사하여 3년 단위로 계약 체결

· 재계약임용 심사관련 기준은 임용시 안내 예정

○ 각 전형 참석 시 신분증(주민등록증, 여권, 운전면허증 중 1개)을 반드시 지참하여야 하며, 신분증을 분실한 경우 거주지 관할 주민센터에서 발급받은 ’주민등록증 발급 신청 확인서‘ 지참

○ 입사지원서 기재착오, 누락 등으로 인한 불이익은 지원자 본인 책임으로 하며, 지원서 작성 내용이 허위 또는 사실과 상이한 경우 합격 및 입사를 취소하고 향후 5년간 입사지원이 제한됨

※ 채용서류 반환에 관한 고지

○ 이 고지는 ｢채용절차의 공정화에 관한 법률｣ 제11조에 따른 것으로, 최종 합격자를 제외한 구직자를 대상으로 기 제출한 채용서류를 반환받을 수 있습니다.

○ 채용에 응시한 구직자 중 최종합격이 되지 못한 구직자는 최종합격자 발표일로부터 14일 이내에 제출한 채용서류의 반환을 청구할 수 있음을 알려드립니다. 다만, 홈페이지 또는 전자우편으로 제출된 경우나 구직자가 국립암센터의 요구 없이 자발적으로 제출한 경우에는 그러하지 아니하며, 천재지변이나 그 밖에 당사에게 책임 없는 사유로 채용서류가 멸실된 경우에는 반환한 것으로 봅니다.

○ 채용서류 반환 청구를 하려는 구직자는 채용서류 반환청구서[채용절차의 공정화에 관한 법률 시행규칙 별지 제3호 서식]를 작성하여 팩스(031-920-1969) 또는 이메일(herajini@ncc.re.kr)로 제출하면, 제출이 확인된 날로부터 14일 이내에 지정한 주소지로 등기 우편을 통하여 발송해 드립니다. 이 경우 등기우편 요금은 수신자 부담으로 하게 되오니 유념하시기 바랍니다.

○ 국립암센터는 구직자의 반환 청구에 대비하여 최종합격자 발표일로부터 14일까지 채용서류를 보관하게 되며, 그때까지 채용서류의 반환을 청구하지 아니할 경우에는 ｢개인정보보호법｣에 따라 지체 없이 채용서류 일체를 파기할 예정입니다.

7. 불합격자 이의신청

○ 신청기간 : 최종합격자 발표일로부터 14일간

○ 신청방법 : 채용 결과 이의 신청서 작성 후 이메일(herajini@ncc.re.kr)로 스캔본 송부(양식 첨부)

○ 이의신청 처리대상

- 이의신청 처리 예외사유가 아닌 경우 이의제기 내용 검토 및 답변 원칙

- 이의신청 접수 시 “신청서 양식”의 응시자 본인의 성명, 수험번호, 자필서명, 연락처 중 1개라도 누락 시 이의신청으로 유효하지 않음

8. 문의처

○ 채용에 관한 문의는 국립암센터 인사상생팀(☎ 031-920-1963, herajini@ncc.re.kr)

으로 문의 바랍니다.

2022. 5. 31.

국 립 암 센 터 원 장

직무분야 직무기술서

인사혁신처 채용 홈페이지

고나트륨혈증, 저나트륨혈증

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고나트륨혈증 (Hypernatremia),  >145mmol/L

■원인
1) Hypovolemic/Isovolemic hypernatremia

-수분 저하에 의해 발생

-당뇨병, 요붕증, 신부전, 이뇨제, 구토, 설사, 발한 등
2) Hypervolemic hypernatremia

-나트륨 증가로 인해 발생

-Primary aldosteronism

■치료

-수분 손실을 막고, 수액을 투여하여 혈장 나트륨 농도를 천천히 낮추는 것
-목표 수치(145mmol/L)에 도달할 때까지 시간당 1mEq/L 이상 감소시키지 않는 것을 원칙으로 함
-경증으로 의식이 명료한 환자는 등장성(isotonic) NaCl 생리식염수 투여

-중증인 경우 생리식염수를 투여하여 혈압을 안정시킨 후, 소변량을 유지시키면서 5% 포도당이나 half saline을 투여 

저나트륨혈증 (Hyponatremia),  <135mmol/L

■원인
-저나트륨혈증은 수분섭취가 과다하거나 나트륨의 소실이 많은 경우에 발생

-SIADH, Primary polydipsia, 갑상선저하증, 심부전, 신증후군 등

■진단

-Plasma osmolality

-Urine osmolality

-Volume status

-Urine Na+ 농도

■치료

-증상과 정도가 심한 경우, 3% 생리식염수을 신경학적 증상이 없어질 때까지 천천히 일정한 속도로 투여

-과도한 교정을 방지하기 위해 반복적으로 혈액 검사를 시행
-증상이 없는 경미한 경우는 생리식염수를 투여하면서 수분 섭취를 제한

#Reference

1) Harrison’s Principles of Internal Medicine, 20th Edition

2) https://m.blog.naver.com/PostView.naver?isHttpsRedirect=true&blogId=hyouncho2&logNo=221178723108 

3) https://www.amc.seoul.kr/asan/healthinfo/disease/diseaseDetail.do?contentId=32308 

4) https://www.osmosis.org/notes/Hypernatremia_and_hyponatremia

고나트륨혈증, 저나트륨혈증

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만성신질환 (CKD; Chronic kidney disease)

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1. 만성신질환(CKD) 정의

: 만성 신질환은 임상적으로 원인 질환과 관계없이 신손상 또는 60mL/min/1.73㎡미만의 사구체 여과율 감소가 3개월 이상 지속되었을 때로 정의한다.

: 만성 신질환은 사구체 여과율의 감소 정도에 따라 5단계로 분류할 수 있다.

: 사구체 여과율에는 변화가 없더라도 신손상의 징후가 3개월 이상 지속되면 만성 신질환으로 분류함으로써 조기에 치료를 시작할 수 있다

2. CKD의 빈혈 원인

1) EPO 생성 부족

2) 적혈구 생존 감소

3) 만성염증에 의한 철분 이용 장애

4) 부갑상선 기능 항진증에 의한 골수 섬유화

5) 잦은 검사와 투석에 의한 혈액 손실

6) 불충분한 투석

3. CKD 환자의 부갑상선 기능 항진증 원인 및 치료

■원인

-낮은 eGFR → 혈중 phosphate 증가 → 혈중 phosphate가 혈중 Ca2+에 결합 → 혈중 Ca2+ 농도 감소 
-비타민 D가 신장에서 활성되지 못함 → 소장에서 Ca2+ 흡수 감소

-혈중 Ca2+ 농도 증가시키기 위해, 부갑상선 기능 항진

■치료

1) 혈중 Phosphate 농도 낮추기
- Phosphate 포합된 음식 섭취 줄이기
- Phosphate binder 사용하여, 흡수 억제하고 체외로 배출시킴.

2) 혈중 Ca2+ 농도 조절

- Ca2+ 농도를 너무 높이면 low PTH에 의한 low bone turnover가 발생하므로, target Ca2+ < 9.5mg/dL로 유지

3) PTH 정상화
- Calcitriol, synthetic vit D analogue로 PTH 감소시킴

4. CKD 환자 투석 적응증

1) 요독증(Uremic symptom)이 나타날 경우
2) 조절되지 않는 고칼륨혈증
3) 조절되지 않는 Pulmonary edema, ECF volume 과다
4) 약물로 조절되지 않는 대사성 산증
5) 출혈성 경향
6) Creatine clearance가 낮은 경우 (eGFR < 10ml/min per 1.73m^2)

5. 투석 원리

1) Diffusion(확산) - 노폐물 제거

-농도차에 의해 용질이 반투막을 경계로 이동하는 현상

-아주 작은 물질은 확산에 의해서 투석으로 제거 됨

2) Osmosis(삼투) - 수분 제거

-농도차에 의해 용매인 수분이 이동하는 현상

-환자 체내의 과다한 체액이 혈액에서 투석액으로 이동함

3) Ultrafiltration(초미세여과) - 수분 제거

-반투과막을 경계로 수압에 의해 수분의 이동이 일어나는 현상

-만성신부전 환자의 과다한 수분을 제거하는 중요한 기전

4) Convection(대류) - 노폐물 제거

-초미세여과가 일어날 때 수분 속의 용질은 물에 이끌려 이동하게 되는데, 이 용질의 이동이 convection

-혈액 속의 노폐물을 제거하는 역할

RPGN (Rapidly progressive glomerulonephritis) 

■임상경과

-콩팥이 빠르게 나빠지는 것이 특징이며, 자연 호전되지 않고 수주~수개월에 걸쳐 CKD로 이행한다.
1) Renal failure over weeks
2) Proteinuria (<3.5g/day)
3) Hematuria, RBC casts
4) BP normal
5) Features of vasculitis (발열, 관절통)

■원인질환

-Goodpasture syndrome

-SLE(systemic lupus erythematosus)

-Wegener's syndrome

#Reference

1) Harrison’s Principles of Internal Medicine, 20th Edition

2) Romagnani, Paola, et al. "Chronic kidney disease." Nature reviews Disease primers 3.1 (2017): 1-24.

3) https://www.semanticscholar.org/paper/New-membrane-technologies-for-dialysis-Lu/b0b6a864a065a2819e11582795bbaf275b63c0ee

4) http://www.poongsung1004.com/clinic1/clinic1_01.htm

5) https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/rapidly-progressive-glomerulonephritis

만성신질환 (CKD; Chronic kidney disease)

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급성신손상 (AKI; Acute kidney injury)

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1. 급성신손상 정의

: 아래 세 가지 기준 중 적어도 하나라도 만족할 시, 급성신손상으로 정의한다.
  - 48시간 이내에 serum Cr이 0.3mg/dl 이상 상승한 경우
  - 7일 이내에 serum Cr의 baseline이 1.5배 이상 상승한 경우
  - 6시간 이상 지속되는 urine output이 0.5ml/kg/hr 보다 적게 나오는 경우

2. 급성신손상 병인

: AKI는 병인에 따라 신전성(prerenal), 내인성(intrinsic), 신후성(postrenal)으로 구분한다.

1) 신전성 급성 신손상(prerenal AKI)

-신장 자체의 이상은 없으나 저혈량증, 심박출량 감소, 신 전신 혈관저항비 증가 등으로 인하여 신장에 공급되는 혈액량이 저하(low perfusion)되어 발생한다.

-손상 유발 약물: NSAIDs(aspirin), ARB(Losartan), ACEi(Captopril) 등

2) 내인성 급성 신손상(intrinsic AKI)

-신장 실질의 이상을 일으키는 많은 질환에 합병되지만 대부분은 신장으로의 혈류 감소에 의한 허혈이나 신독소에 의해서 발생한다.

-손상 유발 약물: 항암제(Cisplatin), 항진균제(Amphotericin B), DMARDs(Methotrexate) 등

3) 신후성 급성 신손상(postrenal AKI)

-요로의 폐색(obstruction of urine flow)에 의해서 발생한다

-손상 유발 약물: 항콜린제(Atropine, Diphenhydramine, Oxybutynin) 등

#Reference

1) Harrison’s Principles of Internal Medicine, 20th Edition

2) https://www.grepmed.com/images/2950/nephrology-diagnosis-kidney-acute-kdigo

급성신손상 (AKI; Acute kidney injury)

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알레르기비염 (Allergic rhinitis)

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알레르기비염 (Allergic rhinitis) 증상

: 콧물이 물처럼 나온다

: 코막힘이 있다

: 재채기를 한다

: 코가 가렵다

: 눈이 충혈되고 간지럽다

: 봄이나 가을에 더 심해진다

#Reference

1) https://medlineplus.gov/ency/article/000813.htm

알레르기비염 (Allergic rhinitis)

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