유전체 정보분석 전문가 기본과정 I

Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼
다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의
중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.
서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의
맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계
package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 12일
간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정I 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다.


 일시 및 장소

일 시 : 2022 7 4() ~ 2022 7 19()                    

장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원, 서울의대 정보의학실
인 원 : 35명 내외
등록비 : 무료

 일정별 프로그램

시간 7/4 (월) 7/5 (화) 7/6 (수) 7/7 (목) 7/8 (금)
주제 R 통계학 R 통계학 NGS 자료처리 파이썬 파이썬
9:00~
10:35
Starting with R Microarray data analysis I Germline Analysis Pipeline Starting with Python Medical informatics practice 1
10:45~
12:15
Data manipulation
with R
Microarray Data Analysis
II
Genome assembly practice
I
Data structure of python Medical informatics practice
2
12:15~
13:15
중  식 
주제 R 통계학 R 통계학 NGS 자료처리 파이썬 파이썬
13:15~
14:50
Statistical Analysis
I
Classification using
R
Genome assembly practice
II
Functions of Python Defining Class
15:00~
16:35
Statistical Analysis
II
Cell line Data at
GDSC & CCLE
Genome annotation practice Regular expression Python machine learning
16:45~
18:15
Advanced R graphics Exploratory Data Analysis
and ggplot2
Evolution analysis practice Bioinformatics Practice Python visualization
시간 7/11 (월) 7/12 (화) 7/13 (수) 7/14 (목) 7/15 (금)
주제 리눅스
프로그래밍
리눅스
프로그래밍
NGS 자료처리 R 통계학 엑솜 및 전장
유전체
9:00~
10:35
Linux file system Linux Permission PreProcessing Reshaping data
and Cluster
Germline calling
10:45~
12:15
Editing with VI Linux Internet,
Network
CellQC
with R
Evaluation and Validation Germline filtering/ Annotation
12:15~
13:15
중  식 
주제 리눅스
프로그래밍
리눅스
프로그래밍
NGS 자료처리 R 통계학 엑솜 및 전장
유전체
13:15~
14:50
Linux Shell
Programming
Linux Server PostProcessing1 Advanced pathway analysis Somatic calling
15:00~
16:35
Linux Operation Linux Multitasking and Cluster PostProcessing2 Survival analysis Somatic Filtering/ Annotation
16:45~
18:15
Advanced Programming Linux LVM Interpretation Case study CNV
시간 7/18 (월) 7/19 (화)      
주제 엑솜 및 전장
유전체
전사체
후성유전체
     
9:00~
10:35
Cancer Genome Analysis Non-coding RNA Analysis      
10:45~
12:15
Somatic Variant Detection
Gene Fusion Analysis
RNA-Seq Gene Expression
Analysis
     
12:15~
13:15
중  식 
주제 엑솜 및 전장
유전체
전사체
후성유전체
     
13:15~
14:50
Advanced Cancer Genome
Data Analysis
Sequence-level
Transcriptome Analysis
     
15:00~
16:35
Somatic CNV detection Epigenome Data Analysis      
16:45~
18:15
Multiomics and
Precision Medicine
Epigenome Tools & Databases
Visualization of DNA Methylation Data
     

 

  • 교육대상:

    (1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
    (2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
    (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자

  • 지원절차:

    서류 전형 및 합격자 개별 통지
    원서교부 및 접수기간 : 2022.6.15 ~ 2022.6.23
    제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
         본 강의는 현장강의로 진행합니다.
    사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
    홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course9.html
    지원방법 : 이메일 제출(우편 접수 불가)
    합격자 발표일시 : 2022.6.28 (예정)

지원서 다운로드(한글)
지원서 다운로드(워드)

 

 실습 컴퓨터

강의실에 개인 컴퓨터가 없으므로, 실습 시 개인노트북 반드시 지참 (CPU i5 이상, RAM 16GB 이상 권장)
Apple M1칩 노트북의 경우, 프로그램 호환성 문제로 일부 실습 프로그램은 지원이 안될 수 있습니다.

장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
교 통 : 5호선 동대문역사문화공원역 7번 출구에서 320m
   2호선 을지로4가역 7번 출구에서 340m
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.

 

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