1.       개    요

○      목         적  :  한국바이오협회는  유전체  분석  관련  직종의  재직·연구자의  직무능력  향상을  위해 단기과정의 교육 프로그램을 운영함.

○      지 원 부 처  :  산업통상자원부, 한국산업기술평가관리원

○      교 육 주 관  :  한국바이오협회

○      과   정  명  :  유전체  분석  분야  재직·연구자  전문  교육

○      교   육   비  :  무료 (단, 식비 및 교통비, 주차비는 본인부담)

2.       교육 프로그램

•  Metagenome 연구개요 및 동향

최근 트랜드로 부상하고 있는 장내미생물 등의  Metagenome  분석이  활발하게  진행되고 있다. 이러한 Metagenome 연구에 대한 전반적인 내용 및 동향에 대해서 살펴본다.

1.      Metagenome 연구개요

2.      Metagenome 시장현황 및 전망

3.      Metagenome 주요 정책 및 동향

4.      마이크로바이옴 치료제 산업 전망

•  Metagenome 분석 16S rRNA 분석(Tools & Database)

Metagenome 분석에는 크게 16S rRNA 분석과 Whole  Metagenome  분석이 있는데  그 중 첫 번째인 16S rRNA 분석에 대한 기본적인 내용에 대해서 공부한다. 16S rRNA 분석에 활용되는 전반적인 Tools의 종류와 활용  방법에  대하여  공부하며  사용 할 수 있는 Database에 대한 중요성을 인지한다.

1.      마이크로바이옴  유전체  정보 생산방법

2.      16S rRNA hypervariable region

3.      다양한 16S rRNA 분석 방법 및 데이터베이스 소개

•  Whole Metagenome 분석

Metagenome 분석 중 두 번째인 whole Metagenome 분석에 대한 기본적인  설명  및  16S  rRNA  분석과의  차이점  그리고  Whole  Metagenome  분석의  필요성에  대한 이해를 학습한다.

•  Metagenome 분석 결과를 활용한 임상 연구 사례

최근에 다양한 분야에서 활용하고 있는 Metagenome 임상 연구 사례를 예로 들어 분석의 중요성과 앞으로 어떻게 분석을 진행해야 할지에 대한 방향을 제시한다.

-      Human Metagenome 분석 연구 사례

-      Animal Metagenome 분석 연구 사례

-      Marine  Metagenome  분석  연구 사례

-      Food & Probiotics 분석 연구 사례

•  16S rRNA Metagenome 분석 방법

16S rRNA 분석을 진행하기 위해서는 다양한 분석 방법 및 Tools이 있으며 다양한 데이터베이스를 사용할 수 있다. 가장 적합한 분석 방법을 이용하여 분석하는 방법을 처음부터 자세하게 설명한다.

- 2일 차

•  Metagenome 샘플데이터(분변) 분석 기초  이론  및  실습(QIIME1  프로그램  사용)

실제 Metagenome 샘플데이터를 활용하여 분석을 진행한다. 실습을 진행하면서 기초 이론을 한번더 복습하고 자세하게 학습한다.

QIIME1 분석 프로그램을 사용하며 기본적인  명령어  input,  output  값들에  대한  정보  및 분석 parameter에 대한 설명을 제공한다.

1.      전체 Workflow 설명

2.      Demultiplexing & Quality filtering

3.      Chimera checking

4.      OTU clustering

5.   Diversity Analysis

•  Metagenome 분석 결과의 이해 및 해석 및 데이터베이스 결과 비교

분석을 완료한 후 결과 파일을 이용하여 우리가 얻을 수 있는 정보에 대해서 학습한다. 다양한 정보를 얻을 수 있으며 또한 데이터베이스의 차이에 따른 결과 비교도 학습한다.

1.      기초 QIIME 분석 결과 확인 및 해석

2.      Taxonomy annotation

3.      α  - Diversity

4.   β  - Diversity

•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 이론

분석결과를 활용하여 기본적인 분석내용을 학습이 가능하지만 좀 더 다양한 분석 방법 및 통계 기법을 활용하여 보기 쉽고 이해하기 쉬운 그래프 활용방법에 대한 이론을 공부한다.

     -   Heatmap, Multivariate, Univariate, Coremicrobiome, LEfSe & Group analysis

•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 실습

다양한 통계 기법 및 분석 프로그램을 활용하여 대한 분석을 진행했던 결과 파일에  대한 새로운 결과 분석 실습을 공부한다. 

    -   Heatmap, Multivariate, Univariate, Coremicrobiome, LEfSe & Group analysis