유전체 정보분석 전문가 기본과정 II Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.
서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의 맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계 package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 매주 토요일 총 12주 간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정II 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다.
일 시 : 2019년 11월 2일(토) ~ 2020년 1월 18일(토) 오전 9시 ~ 오후 6시(매주 토요일) 장 소 : 서울대학교 의과대학
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원
인 원 : 30명
등록비 : 등록비 무료 (강의교재 제공)
■ 일정별 프로그램
시간 | 11/2 (토) | 11/9 (토) | 11/16 (토) | 11/23 (토) | 11/30 (토) | 주제 | 오리엔테이션 | 리눅스
프로그래밍 | 리눅스
프로그래밍 | 파이썬
프로그래밍 | 파이썬
프로그래밍 | 강사 | 김주한
(서울의대) | 권영호
(서울여대) | 권영호
(서울여대) | 오지인
| 오지인
| 9:00~
9:30 | Introduction
| Linux Shell
Programming | Linux Server
| Introduction to
Python | Application of
Python | 9:40~
11:20 | Orientation 1
| Linux Operation
| Linux Multitasking
and Cluster | Starting with
Python | Medical informatics
practice 1 | 11:30~
13:00 | Orientation 2
| Advanced
Programming | Linux LVM
| Data structre of
Python | Medical informatics
practice 2 | 13:00~
14:00 | 중 식 | 주제 | 리눅스
프로그래밍 | 리눅스
프로그래밍 | 리눅스
프로그래밍 | 파이썬
프로그래밍 | 파이썬
프로그래밍 | 강사 | 권영호
(서울여대) | 권영호
(서울여대) | 권영호
(서울여대) | 오지인
| 오지인
| 14:00~
15:10 | 리눅스 개요 및 설치
| Linux User and
Root | Linux Tuning
| Functions of
Python | Defining Class
| 15:20~
16:30 | Linux file system
| Linux Permission
| Linux Package and
Compile | Regular expression
| Python Machine
Learning | 16:40~
18:00 | Editing with VI
| Linux Internet,
Network | Linux Security
| Bioinformatics
Practice | Python
visualization |
시간 | 12/7 (토) | 12/14 (토) | 12/21 (토) | 12/28 (토) | 1/4 (토) | 주제 | R 통계학 | R 통계학
| NGS 자료처리
| NGS 자료처리
| 엑솜 및 전장
유전체 | 강사 | 김재환
(서울의대) | 김재환
(서울의대) | 박민영
(DNALink) | 박민영
(DNALink) | 신은순
(DNALink) | 9:00~
9:30 | Introduction
| Machine learning algorithms for
biomedical informatics | Introduction of whole genome de
novo analysis | Overview
| Intro to Germline
WGS/WES | 9:40~
11:20 | Starting with R
| Microarray data
analysis 1 | k-mer analysis (estimated genome
size) practice | PreProcessing
| Germline Calling
| 11:30~
13:00 | Data manipulation
with R | Microarray data
analysis 2 | Genome assembly
practice 1 | CellQC | Germline filtering/
Annotation | 13:00~
14:00 | 중 식 | 주제 | R 통계학 | R 통계학
| NGS 자료처리
| NGS 자료처리
| 엑솜 및 전장
유전체 | 강사 | 김재환
(서울의대) | 김재환
(서울의대) | 박민영
(DNALink) | 박민영
(DNALink) | 신은순
(DNALink) | 14:00~
15:10 | Statistical analysis
I | Classification using
R | Genome assembly
practice 2 | PostProcessing1
| Somatic calling
| 15:20~
16:30 | Statistical analysis
II | Evaluation and
validation | Genome annotation
practice | PostProcessing2
| Somatic Filtering/
Annotation | 16:40~
18:00 | Advanced R graphics and
ggplot2 | Case study
| Evolution analysis
practice | Interpretation
| CNV
|
시간 | 1/11 (토) | 1/18 (토) | | | | 주제 | 전사체
후성유전체 | 전사체
후성유전체 |
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| 강사 | 이승재
(DNALink) | 이승재
(DNALink) |
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| 9:00~
9:30 | Intro to RNA-Seq
analysis | Epigenomics 소개
biomedical informatics |
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| 9:40~
11:20 | Set up Basic analysis
environment | Methyl seq 실습 1
|
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| 11:30~
13:00 | Reference mapping to
Genome | Methyl seq
실습 2 |
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| 13:00~
14:00 | 중 식 | 주제 | 전사체
후성유전체 | 전사체
후성유전체 |
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| 강사 | 이승재
(DNALink) | 이승재
(DNALink) |
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| 14:00~
15:10 | Abundance
estimation | ChIP seq
실습 1 |
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| 15:20~
16:30 | Differential expressed genes
prediction | ChIP seq
실습 2 |
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| 16:40~
18:00 | Functional study
| ChIP seq
실습 2 |
|
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교육대상:
(1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
(2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
(3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자
지원절차:
서류 전형 및 합격자 개별 통지
원서교부 및 접수기간 : 2019. 9. 24 ~ 2019. 10. 15
제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course10.html
지원방법 : 이메일 혹은 직접 제출 (우편 접수 불가)
합격자 발표일시 : 2019.10.20. (예정) |
