[Metagenome] 2019년 10월, 유전체 분석 분야 재직·연구자 전문 교육

#생물정보학 교육정보

￮ 교육명칭 : 2019년도 유전체 분석 분야 재직·연구자 전문 교육

￮ 교육기관 : 한국바이오협회

￮ 모집대상 : 유전체 분석 분야 재직 및 연구자, 데이터 분석 결과에 대한 이해 및 해석이 필요한 자

￮ 교육기간 : 2019년 10월 24일~25일(2일)

￮ 모집기간 : 2019년 10월 20일(일)까지

￮ 교육장소 : 판교 코리아바이오파크 B동 세미나실

￮ 준 비 물 : 실습교육을 위해 무선인터넷이 가능한 노트북 지참

￮ 비 고 : 자세한 교육 내용 및 신청 방법은 붙임,

교육신청 페이지 주소(http://naver.me/F8LwJ7aT)

￮ 문의사항 : 한국바이오협회 유전체 분석 교육 담당자

(전화) 031-628-0032 / (이메일) winner@koreabio.org

1.       개    요

○      목         적  :  한국바이오협회는  유전체  분석  관련  직종의  재직·연구자의  직무능력  향상을  위해 단기과정의 교육 프로그램을 운영함.

○      지 원 부 처  :  산업통상자원부, 한국산업기술평가관리원

○      교 육 주 관  :  한국바이오협회

○      과   정  명  :  유전체  분석  분야  재직·연구자  전문  교육

○      교   육   비  :  무료 (단, 식비 및 교통비, 주차비는 본인부담)

2.       교육 프로그램

 

일 자	교육 시간	세부 내용	강 사 명
1일차 10/24 (목)	10:00~11:00	•  Metagenome 연구개요 및 동향	3BIGS 박준형 대표
	11:00~12:00	•  Metagenome 분석 16S rRNA 분석(Tools & Database) •  Whole Metagenome 분석	3BIGS 김광민 선임
	12:00~13:00	점 심
	13:00~14:00	•  Metagenome 분석 결과를 활용한 임상 연구 사례	3BIGS 김광민 선임
	14:00~14:50	•  16S rRNA Metagenome 분석 방법	3BIGS 김광민 선임
	14:50~15:10	휴식  및  추가  질문 사항
	15:10~17:00	•  Metagenome 분석에 필요한 기초 Linux 이론 및 실습	3BIGS 김광민 선임
2일차 10/25 (금)	10:00~12:00	•  Metagenome 샘플데이터(분변) 분석 기초 이론 및 실습 (QIIME1 프로그램 사용)	3BIGS 김광민 선임
	12:00~13:00	점심  및  추가  질문 사항
	13:00~14:00	•  Metagenome 분석 결과의 이해 및 해석 및 데이터베이스 결과 비교	3BIGS 김광민 선임
	14:00~14:50	•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 이론	3BIGS 김광민 선임
	14:50~15:00	휴식  및  추가  질문 사항
	15:00~17:00	•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 실습	3BIGS 김광민 선임

 

- 1일 차

---

•  Metagenome 연구개요 및 동향

최근 트랜드로 부상하고 있는 장내미생물 등의  Metagenome  분석이  활발하게  진행되고 있다. 이러한 Metagenome 연구에 대한 전반적인 내용 및 동향에 대해서 살펴본다.

1.      Metagenome 연구개요

2.      Metagenome 시장현황 및 전망

3.      Metagenome 주요 정책 및 동향

4.      마이크로바이옴 치료제 산업 전망

•  Metagenome 분석 16S rRNA 분석(Tools & Database)

Metagenome 분석에는 크게 16S rRNA 분석과 Whole  Metagenome  분석이 있는데  그 중 첫 번째인 16S rRNA 분석에 대한 기본적인 내용에 대해서 공부한다. 16S rRNA 분석에 활용되는 전반적인 Tools의 종류와 활용  방법에  대하여  공부하며  사용 할 수 있는 Database에 대한 중요성을 인지한다.

1.      마이크로바이옴  유전체  정보 생산방법

2.      16S rRNA hypervariable region

3.      다양한 16S rRNA 분석 방법 및 데이터베이스 소개

•  Whole Metagenome 분석

Metagenome 분석 중 두 번째인 whole Metagenome 분석에 대한 기본적인  설명  및  16S  rRNA  분석과의  차이점  그리고  Whole  Metagenome  분석의  필요성에  대한 이해를 학습한다.

•  Metagenome 분석 결과를 활용한 임상 연구 사례

최근에 다양한 분야에서 활용하고 있는 Metagenome 임상 연구 사례를 예로 들어 분석의 중요성과 앞으로 어떻게 분석을 진행해야 할지에 대한 방향을 제시한다.

-      Human Metagenome 분석 연구 사례

-      Animal Metagenome 분석 연구 사례

-      Marine  Metagenome  분석  연구 사례

-      Food & Probiotics 분석 연구 사례

•  16S rRNA Metagenome 분석 방법

16S rRNA 분석을 진행하기 위해서는 다양한 분석 방법 및 Tools이 있으며 다양한 데이터베이스를 사용할 수 있다. 가장 적합한 분석 방법을 이용하여 분석하는 방법을 처음부터 자세하게 설명한다.

•  Metagenome 분석에 필요한 기초 Linux 이론 및 실습

Metagenome 분석을 하기 위해서는 기본적인  Linux  사용이  익숙해야지  분석이  가능하다. 리눅스는 일반 윈도우와는 달리 command 기반의 OS이기 때문에 기본적인 명령어들을 숙지하고 반복 학습하여 분석 실습에 도움이 되고자 한다.

•  Metagenome 분석 결과를 활용한 임상 연구 사례

최근에 다양한 분야에서 활용하고 있는 Metagenome 임상 연구 사례를 예로 들어 분석의 중요성과 앞으로 어떻게 분석을 진행해야 할지에 대한 방향을 제시한다.

- 2일 차

---

•  Metagenome 샘플데이터(분변) 분석 기초  이론  및  실습(QIIME1  프로그램  사용)

실제 Metagenome 샘플데이터를 활용하여 분석을 진행한다. 실습을 진행하면서 기초 이론을 한번더 복습하고 자세하게 학습한다.

QIIME1 분석 프로그램을 사용하며 기본적인  명령어  input,  output  값들에  대한  정보  및 분석 parameter에 대한 설명을 제공한다.

1.      전체 Workflow 설명

2.      Demultiplexing & Quality filtering

3.      Chimera checking

4.      OTU clustering

5.   Diversity Analysis

•  Metagenome 분석 결과의 이해 및 해석 및 데이터베이스 결과 비교

분석을 완료한 후 결과 파일을 이용하여 우리가 얻을 수 있는 정보에 대해서 학습한다. 다양한 정보를 얻을 수 있으며 또한 데이터베이스의 차이에 따른 결과 비교도 학습한다.

1.      기초 QIIME 분석 결과 확인 및 해석

2.      Taxonomy annotation

3.      α  - Diversity

4.   β  - Diversity

•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 이론

분석결과를 활용하여 기본적인 분석내용을 학습이 가능하지만 좀 더 다양한 분석 방법 및 통계 기법을 활용하여 보기 쉽고 이해하기 쉬운 그래프 활용방법에 대한 이론을 공부한다.

     -   Heatmap, Multivariate, Univariate, Coremicrobiome, LEfSe & Group analysis

•  분석결과 데이터를 활용한 Advanced 분석 방법 실습

다양한 통계 기법 및 분석 프로그램을 활용하여 대한 분석을 진행했던 결과 파일에  대한 새로운 결과 분석 실습을 공부한다. 

    -   Heatmap, Multivariate, Univariate, Coremicrobiome, LEfSe & Group analysis

※ 상기 교육내용은 교육기관 및 강사 사정에 의해 변경될 수 있음.

3.       교육 대상

○      모집대상  -  유전체  분석  관련  기업이나  연구소에  재직  중이며, 

                   

                       Metagenome 분석에 관심 있거나 분석을 공부하고 싶으신 분

-  리눅스 활용 가능여부 확인과 Metagenome 분석에 대한 이해도를 확인하기 위한 사전 설문조사 실시 예정 (신청 시 설문조사 첨부)

○      정         원 : 30명 (설문조사 확인 후 선발)

4.       교육 신청

○      신청기간 : 2019년 10월 20일(일)까지

○      신청방법 : 온라인 신청페이지 (http://naver.me/F8LwJ7aT) 에서 접수 (설문조사 첨부)

○      준 비 물 : 실습을 위한 무선인터넷 연결이 가능한 노트북 지참

(클라우드 서버 사용 예정)

5.       교육 장소

○      판교 코리아바이오파크 B동  B1F 세미나실 (경기도 성남시 분당구 대왕판교로 700)

○      자가용 이용 시 주차지원(주차비) 불가 (건물 주차장이 협소하여 대중교통 이용 바람)

6.       문의 사항

○      교육진행 문의 : 한국바이오협회 유전체 분석 교육 담당자, 031-628-0032

○      교육내용 문의 : 3BIGS 김광민 선임 031-8064-1877