DNAnexus (유전체 클라우드)

DNAnexus (유전체 클라우드) Start.

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DNAnexus 

데이터 저장 및 인프라 제공, 시스템설계와 첨단 생물 정보학을 갖춘 데이터 관리 및 분석 등

클라우드 컴퓨팅 인프라 플랫폼 제공하는 2009년 설립된 미국 기업.

DNAnexus에서는?

- 대량의 시퀀싱 데이터를 빠르고! 안전하고! 싸게! 분석.

- 안전한 분석 환경에서 임상 데이터와 유전체 데이터를 통합.

- 공동연구 최적의 플랫폼 제공.

위 플로우가 DNAnexus이 뭘하는 회사인지 잘 나타낸다. 

연구자가 원래 보유한 데이터 + 새롭게 시퀀싱한 데이터가 DNAnexus storage에 저장되고,

강력한 컴퓨팅파워로 Bioinformatics 분석을 슥삭해버려서, 결과를 연구진들과 공유하고 빠르게 논문도 낸단 얘기로 보인다.

# 생물정보학을하는 입장에서, 데이터 저장과 관련 툴을 제공하는 분석 환경을 구축하는게 쉽지않음을 알고 있다.

최근 빠르게 성장하는 클라우드 기반의 genomics 흐름은 여러 요인들이 있지만, 우선 엄청 엄청 편하게 분석할 수 있다는게 큰 장점이라 생각한다.

또한, 수많은 오믹스데이터가 뿜어져나오는 상황에서 메타분석을 위한 최적의 입지를 지닌 클라우드 플랫폼이 되겠다.

단점으로는 보안, 돈 등의 문제가 있을 수 있겠다.

#아래는 DNAnexus의 Data storage이다.

#DNAnexus 플랫폼은 아래 6개의 특징을 자랑한다.

- 세분화된 인증 및 접근 제어

- 버전 제어 된 분석 결과 제공

- 보안 및 개인 정보 보호 준수

- 높은 재현성 및 문서화

- 공동 작업자 액세스의 보안 제어 및 감사

- API 기반의 Laboratory Information Management System (LIMS) 통합.

#아래는 DNAnexus 소개 영상이다.

(개인적인 견해로 영상 제작에 큰 신경을 쓴 것 같지는 않다..)

#DNAnexux는 'RAPID LAUNCH' 를 약속한다고 한다.

고객과 빠르게 컨설팅하여 원하는 분석 환경을 빠르게 셋팅해준다는 설명이 아래 그림이다.

1. Kick-off Consultation (1 day)

-하루 정도면 고객의 디테일한 요청 사항 전부를 상담 가능.

2. Create Integration Plan (1 week)

-통합분석환경 구축을 위한 초안 정도.

3. Implement Integrated Solution (1-2 months)

-프론트엔드, 백엔드 등등 실질적으로 파이프라인 환경 구축.

4. Validate Pipeline (1 month)

-파이프라인의 모든 과정 점검.

5. Production Deployment, Fully Operational (Completion at 90 days)

-완성.

마무리하며..

비용적인 측면을 좀 살펴보려 했는데, 못찾겠다.

자꾸 상담해야 한다고 한다.

다음 칼럼에는 좀더 굵직굵직한 유전체 클라우드 회사를 더 자세하게 다뤄보겠다.

#DNAnexus  홈페이지

https://www.dnanexus.com/

DNAnexus (유전체 클라우드) End.

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