[Mircoarray] DNA 미세배열

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DNA microarray

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: 마이크로어레이는 매우 작은 DNA 조각들이 고체 표면에 집적된 DNA Chip

: 대량 유전자의 발현 정도를 동시에 측정하여, 그룹 간의 유전자 발현 차이를 비교함

*세포에서 전사된 여러 mRNA의 발현 패턴을 분석

: 많은 표본을 동시에 실험하므로, 짧은 시간에 대량의 데이터를 얻을 수 있음

: Dye bias/스캐닝 불량/혼성화 문제 등의 여러 Systemic error를 가지므로 분석에서 보정 필요

Microarray 활용 분야

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ㄱ) 신약 발견

ㄴ) 진단

ㄷ) 단백질체학

ㄹ) 기능유전체학

ㅁ) DNA 시퀀싱

ㅂ) 유전자 발현 동정

ㅅ) 독성유전체학

Microarray 실험 과정

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1) 샘플 수집

- 유전자 발현을 확인할 Normal cell(정상) 및 Cancer cell(질병) 수집

2) mRNA 분리

- 페놀클로로포름과 같은 용매를 통해, 수집된 세포 파쇄물에서 RNA를 추출함

- 추출된 RNA에서 rRNA와 tRNA를 제거하고, mRNA만 남김

3) Labeled cDNA 생성

- 상보적인 cDNA(complementary DNA) 생성을 위해, mRNA의 역전사 반응 수행

- 정상과 질병을 구분할 수 있도록, 서로 다른 형광 표지를 사용

4) 혼성화(Hybridization)

- 합성된 cDNA들은 Chip 위에 뿌려져 혼성화 시작

- 결합되지 않은 서열들은 세척을 통해 제거됨

5) 기기 분석

- 마이크로어레이 스캐너로 cDNA 형광 이미지를 기록

- 각 스팟에 대한 형광 세기 차이에 따라, 유전자 발현 정도가 측정됨

*녹색: 정상

*빨간색: 위암

*노란색: 공통

# 마이크로어레이 실험 영상

#Reference

1) https://www.khanacademy.org/science/high-school-biology/hs-molecular-genetics/hs-biotechnology/a/dna-sequencing

2) https://www.illumina.com/science/technology/next-generation-sequencing/ngs-vs-sanger-sequencing.html

3) https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%83%9D%EC%96%B4_%EC%97%BC%EA%B8%B0%EC%84%9C%EC%97%B4_%EB%B6%84%EC%84%9D

4) https://www.youtube.com/watch?v=0ATUjAxNf6U

5) https://www.semanticscholar.org/paper/Microarray-Analysis-and-Gene-Expression-%3A-A-Review-Subair-AlEisa/a75f33de77e9b7e220c102245fda6fb7bddf3245

6) https://warwick.ac.uk/fac/sci/lifesci/intranet/staffpg/support/genomics_new/microarrays/

[Mircoarray] DNA 미세배열 End

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