CIVIC (Clinical Interpretation of Variants in Cancer)

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CIVIC?

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: CIVIC(Clinical Interpretations of Variants in Cancer)은 오픈소스 커뮤니티 기반의 암 임상 변이 데이터베이스

: 여러 암들의 Somatic variant, Germline variant에 관련된 진단/치료/예후 정보 제공

: 암 변이에 대한 임상적 evidence를 제공하여, 정밀 의료 시대의 정확한 암 변이 해석을 추구

: https://civicdb.org/home

CIVIC 데이터

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: '2019년 10월 기준으로 암 관련 유전자 402개, 변이 2357개, Evidence 6467개 등의 데이터 보유

: CIVIC 데이터는 매일 업데이트되며, 매달 1일에 최종 업데이트된 CIVIC 데이터를 다운받을 수 있음

*물론, 매일 업데이트되는 정보도 'Nightly'라는 항목으로 다운받을 수 있음

: Public API 제공 → https://griffithlab.github.io/civic-api-docs/

CIVIC Evidence Level

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: CIVIC Evidence Level은 임상적 유용성에 따라, A~E로 분류됨

1) Level A - 해당 변이는 의학계에서 검증됨

2) Level B - 해당 변이는 임상시험 또는 환자데이터 정보에 근거함

3) Level C - 해당 변이는 임상저널에서 보고된 경우가 있음

4) Level D - 해당 변이는 In vivo 또는 In vitro 연구에서 관련성이 있었음

5) Level E - 해당 변이는 간접적인 증거를 보임

#Reference

1) https://civicdb.org/home

2) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5367263/

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