[Real time PCR] 실시간 중합효소연쇄반응

[Real time PCR] 실시간 중합효소연쇄반응 Start

BioinformaticsAndMe

1. Real time PCR (=qPCR;quantitative PCR)

---

: Real time PCR(실시간 PCR)은 사이클마다 증폭된 산물의 양을 실시간으로 정량 확인하는 실험법

: 일반적으로 유전자 발현을 측정하는 데 사용

: 미세한 발현 변화를 탐지에는 효과적이지만, 대규모 RNA 연구에는 적합하지 않음

→대규모 RNA 연구는 Microarray 또는 RNAseq 추천

: Real time PCR은 타겟하는 유전자 서열이 필요하기에, 알려진 유전자 연구만 가능함

2. Real time PCR 과정

---

1) 역전사(Reverse transcription)를 통해, RNA를 cDNA(complementary DNA)로 변환

2) 특정 유전자를 증폭하고 탐지하기 위해, Fluorescent reporter 및 PCR 반응을 사용

*Fluorescent reporter

-SYBR Green probe: 형광을 띠는 삽입 물질인 SYBR Green을 넣고 PCR 수행

-Taqman probe: 형광물질과 형광활성억제물질이 끝에 붙은 탐침으로 PCR 수행

3) SYBR Green probe 또는 Taqman probe를 사용하여, 증폭 산물을 실시간으로 정량함

#Real time PCR 소개 영상

#일반 PCR 설명은 아래를 참조

https://bioinformaticsandme.tistory.com/159

#Reference

1) https://www.bio-rad.com/en-dk/applications-technologies/what-real-time-pcr-qpcr?ID=LUSO4W8UU

2) https://www.ebi.ac.uk/training/online/course/functional-genomics-ii-common-technologies-and-data-analysis-methods/real-time-pcr

3) https://www.youtube.com/watch?v=EaGH1eKfvC0

[Real time PCR] 실시간 중합효소연쇄반응 End

BioinformaticsAndMe