유전체 정보분석 전문가 기본과정 II
Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼
다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의
중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.
서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의
맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계
package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 매주 토요일 총 12주
간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정II 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다. 코로나 사태로 소수의 오프라인 수강생과 함께 온라인 수강생을 모집하여 혼합 운영합니다.
■ 일시 및 장소
일 시 : 2020년 9월 5일(토) ~ 2020년 11월 28일(토) 오전 9시 ~ 오후 6시(매주 토요일)
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원
인 원 : 38명(오프라인 16명, 온라인 22명)
등록비 : 무료
■ 일정별 프로그램
시간 | 9/5 (토) | 9/12 (토) | 9/19 (토) | 9/26 (토) | 10/10 (토) |
주제 | R 통계학 | R 통계학 | R 통계학 | 파이썬 | 파이썬 |
9:00~ | Starting with R | Microarray data analysis 1 | Reshaping data and Cluster | Starting with Python | Medical informatics practice 1 |
11:30~ | Data manipulation with R | Microarray Data Analysis II | Evaluation and Validation | Data structure of python | Medical informatics practice 2 |
12:50~ | 중 식 | ||||
주제 | R 통계학 | R 통계학 | R 통계학 | 파이썬 | 파이썬 |
13:50~ | Statistical Analysis I | Classification using R | Advanced pathway analysis | Functions of Python | Defining Class |
15:20~ | Statistical Analysis II | Cell line Data at GDSC & CCLE | Survival analysis | Regular expression | Python machine learning |
16:50~ | Exploratory Data Analysis | Advanced R graphics and ggplot2 | Case study | Bioinformatics Practice | Python visualization |
시간 | 10/17 (토) | 10/24 (토) | 10/31 (토) | 11/7 (토) | 11/14 (토) |
주제 | 리눅스 프로그래밍 | 리눅스 프로그래밍 | NGS 자료처리 | NGS 자료처리 | 엑솜 및 전장 유전체 |
9:00~ | Linux file system | Linux Permission | Germline Analysis Pipeline | PreProcessing | Germline calling |
11:30~ | Editing with VI | Linux Internet, Network | Genome assembly practice I | CellQC with R | Germline filtering/ Annotation |
12:50~ | 중 식 | ||||
주제 | 리눅스 프로그래밍 | 리눅스 프로그래밍 | NGS 자료처리 | NGS 자료처리 | 엑솜 및 전장 유전체 |
13:50~ | Linux Shell Programming | Linux Server | Genome assembly practice II | PostProcessing1 | Somatic calling |
15:20~ | Linux Operation | Linux Multitasking and Cluster | Genome annotation practice | PostProcessing2 | Somatic Filtering/ Annotation |
16:50~ | Advanced Programming | Linux LVM | Evolution analysis practice | Interpretation | CNV |
시간 | 11/21 (토) | 11/28 (토) | |||
주제 | 엑솜 및 전장 유전체 | 전사체 후성유전체 | |||
9:00~ | Cancer Genome Analysis | Non-coding RNA Analysis | |||
11:30~ | Somatic Variant Detection Gene Fusion Analysis | RNA-Seq Gene Expression Analysis | |||
12:50~ | 중 식 | ||||
주제 | 엑솜 및 전장 유전체 | 전사체 후성유전체 | |||
13:50~ | Advanced Cancer Genome Data Analysis | Sequence-level Transcriptome Analysis | |||
15:20~ | Somatic CNV detection | Epigenome Data Analysis | |||
16:50~ | Multiomics and Precision Medicine | Epigenome Tools & Databases Visualization of DNA Methylation Data |
(1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
(2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
(3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자
서류 전형 및 합격자 개별 통지
원서교부 및 접수기간 : 2020. 7. 20 ~ 2020. 8. 17
제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
본 강의는 온라인과 현장강의가 동시에 이루지고 있습니다.
강의유형을 기재하지 않거나, TO가 찼을 시 다른 강의에 임의로 배정될 수 있습니다.
사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course10.html
지원방법 : 이메일 제출 (우편 접수 불가)
합격자 발표일시 : 2020.8.26 (예정)
■ 실습 컴퓨터
실습용 컴퓨터가 지급되지 않습니다.
오프라인 수강생 : 개인용 노트북 지참.
온라인 수강생 : 개인용 PC 구비
(i5 이상의 CPU, 16GB 이상의 램 장착)
교 통 : 지하철 5호선 동대문역사문화공원역 6번출구
버스 100번, 105번 퇴계로6가
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.
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