유전체 정보분석 전문가 기본과정 I Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼 다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다. 서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의 맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계 package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 12일 간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정I 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다. 코로나 사태로 소수의 오프라인 수강생과 함께 온라인 수강생을 모집하여 혼합 운영합니다. 일 시 : 2020년 8월 17일(월) ~ 2020년 9월 1일(화) 오전 9시 ~ 오후 6시(매주 평일) 장 소 : 삼선빌딩 교육장 (4호선 회현역 4번출구) 중구 퇴계로 36 주 최 : 한국보건복지인력개발원 주 관 : 서울대학교병원 인 원 : 38명(오프라인 16명, 온라인 22명) 등록비 : 무료
■ 일정별 프로그램
시간 | 8/17 (월) | 8/18 (화) | 8/19 (수) | 8/20 (목) | 8/21 (금) | 주제 | R 통계학 | R 통계학
| R 통계학
| 파이썬
| 파이썬
| 9:00~ 11:20 | Starting with R
| Microarray data analysis 1
| Reshaping data and Cluster | Starting with Python
| Medical informatics practice 1
| 11:30~ 12:50 | Data manipulation with R | Microarray Data Analysis II | Evaluation and Validation
| Data structure of python
| Medical informatics practice 2 | 12:50~ 13:50 | 중 식 | 주제 | R 통계학 | R 통계학
| R 통계학
| 파이썬
| 파이썬
| 13:50~ 15:10 | Statistical Analysis I | Classification using R | Advanced pathway analysis
| Functions of Python
| Defining Class
| 15:20~ 16:40 | Statistical Analysis II | Cell line Data at GDSC & CCLE | Survival analysis
| Regular expression
| Python machine learning
| 16:50~ 18:00 | Exploratory Data Analysis
| Advanced R graphics and ggplot2 | Case study
| Bioinformatics Practice
| Python visualization
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시간 | 8/24 (월) | 8/25 (화) | 8/26 (수) | 8/27 (목) | 8/28 (금) | 주제 | 리눅스 프로그래밍 | 리눅스 프로그래밍 | NGS 자료처리
| NGS 자료처리
| 엑솜 및 전장 유전체 | 9:00~ 11:20 | Linux file system
| Linux Permission
| Germline Analysis Pipeline
| PreProcessing
| Germline calling
| 11:30~ 12:50 | Editing with VI
| Linux Internet, Network | Genome assembly practice I | CellQC with R | Germline filtering/ Annotation
| 12:50~ 13:50 | 중 식 | 주제 | 리눅스 프로그래밍 | 리눅스 프로그래밍 | NGS 자료처리
| NGS 자료처리
| 엑솜 및 전장 유전체 | 13:50~ 15:10 | Linux Shell Programming | Linux Server
| Genome assembly practice II | PostProcessing1
| Somatic calling
| 15:20~ 16:40 | Linux Operation
| Linux Multitasking and Cluster
| Genome annotation practice
| PostProcessing2
| Somatic Filtering/ Annotation
| 16:50~ 18:00 | Advanced Programming
| Linux LVM
| Evolution analysis practice
| Interpretation
| CNV
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시간 | 8/31 (월) | 9/1 (화) | | | | 주제 | 엑솜 및 전장 유전체 | 전사체 후성유전체 |
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| 9:00~ 11:20 | Cancer Genome Analysis
| Non-coding RNA Analysis
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| 11:30~ 12:50 | Somatic Variant Detection Gene Fusion Analysis | RNA-Seq Gene Expression Analysis |
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| 12:50~ 13:50 | 중 식 | 주제 | 엑솜 및 전장 유전체 | 전사체 후성유전체 |
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| 13:50~ 15:10 | Advanced Cancer Genome Data Analysis | Sequence-level Transcriptome Analysis |
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| 15:20~ 16:40 | Somatic CNV detection
| Epigenome Data Analysis
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| 16:50~ 18:00 | Multiomics and Precision Medicine | Epigenome Tools & Databases Visualization of DNA Methylation Data |
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교육대상:
(1) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자 (2) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자 (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 창업 희망자
지원절차:
서류 전형 및 합격자 개별 통지 원서교부 및 접수기간 : 2020. 7. 1 ~ 2020. 7. 28 제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출 본 강의는 온라인과 현장강의가 동시에 이루지고 있습니다. 강의유형을 기재하지 않거나, TO가 찼을 시 다른 강의에 임의로 배정될 수 있습니다. 사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com) 홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course9.html 지원방법 : 이메일 제출 (우편 접수 불가) 합격자 발표일시 : 2020. 8. 7. (예정)
지원서 다운로드(한글) 지원서 다운로드(워드)
■ 실습 컴퓨터 실습용 컴퓨터가 지급되지 않습니다. 오프라인 수강생 : 개인용 노트북 지참. 온라인 수강생 : 개인용 PC 구비 (i5 이상의 CPU, 16GB 이상의 램 장착) 장 소 : 삼선빌딩 교육장 (4호선 회현역 4번출구) 중구 퇴계로 36 교 통 : 지하철 4호선 회현역 4번 출구 주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.
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