BioinformaticsAndMe

[Python] 문자열(String) Start

BioinformaticsAndMe

Python String

: 파이썬 문자열은 작은따옴표(Single quotation) 또는 큰따옴표(Double quotation)로 둘러싸임

→ 'Hello' 또는 "Hello"

# 문자열 Hello 출력
print("Hello")
print('Hello')
Hello
Hello

Assign String to a Variable

: 변수에 문자열을 할당하기 위해서는 'equal sign(=)'을 사용

# 문자열 Hello를 a 변수에 할당 후 출력
a = "Hello"
print(a)
Hello

Python character array

: 파이썬 문자열은 문자의 요소들이 0번째부터 시작되는 배열을 이루고 있음

# 대괄호를 사용하여 문자열 요소에 접근
a = "Hello, World!"
print(a[1])
e

Slicing

: 슬라이스 구문(':', 콜론)을 사용하여 문자열 일부를 리턴할 수 있음

→ [start index]:[end index]

# Index2 ~ Index4 문자 슬라이싱 (Index5는 포함되지 않음)
b = "Hello World"
print(b[2:5])
llo

Negative Indexing

: 음수부호(-)를 사용하여 문자열을 끝에서부터 일부를 리턴할 수 있음

→ [-start index]:[-end index]

# -Index5 ~ -Index3 문자 슬라이싱 (-Index2는 포함되지 않음)
b = "Hello World"
print(b[-5:-2])
Wor

String Concatenation

: 파이썬 문자열은 양수부호(+)를 사용하여 연결지을 수 있음

# 문자열 더하기
a = "Hello"
b = "World"
print(a+b)
HelloWorld

String Length

: len() 함수를 사용하여 문자열의 길이(공백 포함)를 알 수 있음

# 문자열 길이 구하기
a = "Hello, World!"
print(len(a))
13

파이썬 문자열 함수

#Reference

1) https://www.w3schools.com/python/python_strings.asp

2) https://pythonspot.com/array-find/

3) https://netjs.blogspot.com/2019/07/string-slicing-in-python.html

[Python] 문자열(String) End

BioinformaticsAndMe

[Python] 연산자(Operator) Start

BioinformaticsAndMe

Python 연산자

: 파이썬 연산자는 변수 및 특정값에 대한 작업을 위해 사용됨

: 파이썬의 기본 연산자는 7가지로 나뉨

1. 산술 연산자(Arithmetic operator)

2. 할당 연산자(Assignment operator)

3. 비교 연산자(Comparison operator)

4. 논리 연산자(Logical operator)

5. 식별 연산자(Identity operator)

6. 멤버 연산자(Membership operator)

7. 비트 연산자(Bitwise operator)

1. 산술 연산자(Arithmetic operator)

: 산술 연산자는 기본적인 수학 연산을 위해 사용

#Reference

1) https://www.w3schools.com/python/python_operators.asp

2) https://wikidocs.net/1043

3) http://pythonstudy.xyz/python/article/8-%EC%97%B0%EC%82%B0%EC%9E%90

4) https://wikidocs.net/20704

5) https://076923.github.io/posts/Python-6/

[Python] 연산자(Operator) End

BioinformaticsAndMe

[Python] 자료형(Data type) Start

BioinformaticsAndMe

Python data type (자료형)

: 자료형이란 프로그래밍에 사용되는 숫자, 문자열 등 자료 형태의 모든 것

# 정수형(Integer type): 양 또는 음의 정수
1, 2, -8, -42
data_int = 150     #정수형 선언

# 실수형(Float type): 소수점이 포함된 실수
6.8, -13.5, 24e12
data_flo = 9.0     #실수형 선언

# 문자형(String type): 따옴표[ ' 또는 " ]에 들어간 문자형
'abc', "defg", 'ab12cd'
data_str = 'abcd'     #문자형 선언

#논리형(Boolean type): 참 또는 거짓
True, False
data_boo = True     #논리형 선언 (대소문자 구분해야함 → true는 error 발생)

# int(): 정수형 변환
x = int(1)  
y = int(2.8)
z = int("3")
print(x)
print(y)
print(z)
1
2
3

# float(): 실수형 변환
x = float(1)
y = float(2.8)
z = float("3")
w = float("4.2")
print(x)
print(y)
print(z)
print(w)
1.0
2.8
3.0
4.2

# str(): 문자형 변환
x = str("s1")
y = str(2)
z = str(3.0)
print(x)
print(y)
print(z)
s1
2
3.0

#Reference

1) https://wikidocs.net/11

2) https://www.slideshare.net/TonyNguyen197/python-language-data-types-61715303

3) https://www.w3schools.com/python/python_casting.asp

4) http://www.techgeekbuzz.com/python-type-conversion-type-casting/

[Python] 자료형(Data type) End

BioinformaticsAndMe

[Python] 주석 처리 Start

BioinformaticsAndMe

주석(Comment)

: 주석(comment)이란 무엇을 하는지 자연어로 기록하는 것 (프로그래밍에서 내용을 메모하는 목적)

# 단순 연산 결과 구하기
Result_1 = 1 + 1
Result_2 = 150 + 150

print(Result_1)
#print(Result_2)     # 주석 처리됐으므로 Result_2는 출력되지 않음
2

#Reference

1) https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%A3%BC%EC%84%9D_(%ED%94%84%EB%A1%9C%EA%B7%B8%EB%9E%98%EB%B0%8D)

2) https://www.zentut.com/python-tutorial/python-comments/

[Python] 주석 처리 End

BioinformaticsAndMe

Anaconda 설치 Start

BioinformaticsAndMe

Anaconda?

: 아나콘다(Anaconda)는 데이터 과학, 빅데이터 처리, 머신러닝 분석 등을 위한 파이썬 및 R의 자유-오픈 소스 배포판

: Conda라는 패키지 관리 시스템으로 관리되며, 윈도우/리눅스/macOS에 적합한 1,400개 이상의 데이터 분석 패키지를 포함 (Numpy, Pandas 등)

: 파이썬 입문자들에게 추천되나, 설치 시간이 오래 걸림

: 아나콘다 설치를 위해선 https://www.anaconda.com/ 에서 본인 OS에 맞는 프로그램을 다운받아 설치

1. Anaconda 다운로드

: 본인의 OS에 맞게 다운 (https://www.anaconda.com/distribution/#download-section)

→ 해당 설치 과정은 윈도우 10 기준으로 진행함

: 3.x 버전에서 주로 개발과 업데이트가 이루어짐

→ 따라서 지금 파이썬에 입문한다면, 3.x 버전을 설치하는 것이 유리

2. 접근 권한

: 사용자 환경에 따라 권한 설정

#Reference

1) https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%95%84%EB%82%98%EC%BD%98%EB%8B%A4_(%ED%8C%8C%EC%9D%B4%EC%8D%AC_%EB%B0%B0%ED%8F%AC%ED%8C%90)

2) https://namu.wiki/w/Python

3) https://realpython.com/python-windows-machine-learning-setup/

4) https://www.anaconda.com/enterprise/

5) https://www.slideshare.net/continuumio/distributed-computing-on-your-cluster-with-anaconda-webinar-2015

Anaconda 설치 End

BioinformaticsAndMe

Python JSON Start

BioinformaticsAndMe

Python JSON

# requests 라이브러리
import requests

# 엔드포인트의 우주비행사 데이터 리턴
response = requests.get("http://api.open-notify.org/astros.json")
print(response.status_code)
200   #200은 우리의 request가 성공적이었음을 의미

# API response가 json 포맷임을 확인
print(response.json())
{'people': [{'name': 'Alexey Ovchinin', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Nick Hague', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Christina Koch', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Alexander Skvortsov', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Luca Parmitano', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Andrew Morgan', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Oleg Skripochka', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Jessica Meir', 'craft': 'ISS'}, {'name': 'Hazzaa Ali Almansoori', 'craft': 'ISS'}], 'number': 9, 'message': 'success'}

# json 라이브러리
​import json

# Python JSON 객체의 구조화된 형태를 출력하는 definition
def jprint(obj):
    text = json.dumps(obj, sort_keys=True, indent=4)
    print(text)

# 데이터 구조를 더 쉽게 이해하도록 출력 (우주에 있는 9명과 각각의 이름)
jprint(response.json())
{
    "message": "success",
    "number": 9,
    "people": [
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Alexey Ovchinin"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Nick Hague"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Christina Koch"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Alexander Skvortsov"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Luca Parmitano"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Andrew Morgan"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Oleg Skripochka"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Jessica Meir"
        },
        {
            "craft": "ISS",
            "name": "Hazzaa Ali Almansoori"
        }
    ]
}

# lat(latitude;위도), lon(longitude;경도) 파라미터 지정
parameters = {
    "lat": 40.71,
    "lon": -74
}

# 파라미터에 지정된 좌표를 사용하여 request
response = requests.get("http://api.open-notify.org/iss-pass.json", params=parameters)

# JSON 포맷으로 response 결과 확인
jprint(response.json())
{
    "message": "success",
    "request": {
        "altitude": 100,
        "datetime": 1570007025,
        "latitude": 40.71,
        "longitude": -74.0,
        "passes": 5
    },
    "response": [
        {
            "duration": 410,
            "risetime": 1570037505
        },
        {
            "duration": 643,
            "risetime": 1570043152
        },
        {
            "duration": 614,
            "risetime": 1570048982
        },
        {
            "duration": 553,
            "risetime": 1570054871
        },
        {
            "duration": 593,
            "risetime": 1570060715
        }
    ]
}

#Reference

1) https://ko.wikipedia.org/wiki/JSON

2) https://blog.naver.com/zzzcc33/221594710730

3) https://realpython.com/python-json/

Python JSON End

BioinformaticsAndMe

Python API Start

BioinformaticsAndMe

#API 기초 학습을 위해 아래 포스트 참조

https://bioinformaticsandme.tistory.com/135

#pip 설치
pip install requests

#conda 설치
conda install requests

import requests

#request를 만들고 결과값을 출력
request = requests.get('http://api.open-notify.org')
print(request.text)

#response code 확인 (200 : request가 성공적으로 작동)
print(request.status_code)
200

request2 = requests.get('http://api.open-notify.org/fake-endpoint')
print(request2.status_code)
404

#Reference

1) https://www.dataquest.io/blog/python-api-tutorial/

2) https://medium.com/quick-code/absolute-beginners-guide-to-slaying-apis-using-python-7b380dc82236

3) https://blog.rapidapi.com/how-to-use-an-api-with-python/

4) https://itnext.io/api-calls-and-http-status-codes-e0240f78f585

Python API End

BioinformaticsAndMe

Variable (Python 변수) Start

BioinformaticsAndMe

Variable (변수)

x = 5
y = "John"

print(x)
print(y)

5
John

#Reference

1) https://www.w3schools.com/python/python_variables.asp

2) https://www.guru99.com/variables-in-python.html

3) https://realpython.com/python-variables/

Variable (Python 변수) End

BioinformaticsAndMe

Python이 성장하는 7가지 이유 Start

BioinformaticsAndMe

최근 파이썬이 급속하게 성장해온 이유를

7가지로 정리해 보았다.

(주관적인 견해이므로 이견이 있을 수 있다)

1. Popular programming language

3. Open source program

7. Community

#Reference

1) https://spectrum.ieee.org/at-work/innovation/the-2018-top-programming-languages

2) https://www.zdnet.co.kr/view/?no=20161230153750&re=R_20180713105452

3) https://namu.wiki/w/Python

4) https://wikidocs.net/6

5) https://www.ivy-seed.com/?fbclid=IwAR2H1eYAWy_JyZnPyc5N12efvNocxg2B3WNYnlxtk-0xwQwGyyjtX6HAB9A

6) https://docs.python.org/ko/3/library/index.html

7) http://www.ciokorea.com/news/38148

Python이 성장하는 7가지 이유 End

BioinformaticsAndMe

Python 시작 Start

BioinformaticsAndMe

파이썬(python)은

▶1991년 프로그래머인 귀도 반 로섬(Guido van Rossum)이 발표한 고급 프로그래밍 언어

▶플랫폼 독립적이며 인터프리터식, 객체지향적, 동적 타이핑 대화형 언어

▶“Monty Python’s Flying Circus” (영국 코미디프로)에서 파이썬 이름이 유래

▶귀도는 구글에 근무했고 현재 DropBox에서 근무 중

파이썬 로고(logo)

두 마리의 뱀이 겹쳐 있음

파이썬 Language

플랫폼 독립적 인터프리터 언어

▶플랫폼 = OS (Operating System)

윈도우, 리눅스, 안드로이드, 맥OS 등 프로그램이 실행되는 운영 체제

▶독립적인 = 관계없는, 상관없는

OS에 상관없이 프로그램을 작성되면 여러 플랫폼에서 사용 가능

▶인터프리터

소스코드를 바로 실행할 수 있게 지원하는 프로그램 실행 방법

Philosophy of Python

Life is short, You need Python

인생은 짧다, 당신은 파이썬이 필요하다

#Reference

1) https://ko.wikipedia.org/wiki/%EA%B7%80%EB%8F%84_%EB%B0%98_%EB%A1%9C%EC%84%AC

2) https://namu.wiki/w/Python

3) https://en.wikipedia.org/wiki/Python_(programming_language)

Python 시작 End

BioinformaticsAndMe