- 교육대상:
(1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
(2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
(3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자 - 지원절차:
서류 전형 및 합격자 개별 통지
원서교부 및 접수기간 : 2021. 5. 10 ~ 2021. 5. 14
제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
본 강의는 온라인과 현장강의가 동시에 이루지고 있습니다.
강의유형을 기재하지 않거나, TO가 찼을 시 다른 강의에 임의로 배정될 수 있습니다.
사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course10.html
지원방법 : 이메일 제출(우편 접수 불가)
합격자 발표일시 : 2021.6.4 (예정)
■ 실습 컴퓨터
강의실에 개인 컴퓨터가 없으므로, 실습 시 개인노트북 반드시 지참 (i5 이상의 CPU, 16GB 이상의 램 장착)
장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
교 통 : 5호선 동대문역사문화공원역 6번 출구에서 320m
2호선 을지로4가역 7번 출구에서 340m
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.
유전체 정보분석 전문가 기본과정 II
Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼 다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의 맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계 package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 매주 토요일 총 12주 간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정II 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다. 코로나 사태로 소수의오프라인 수강생과 함께 온라인 수강생을 모집하여 혼합 운영합니다.
■ 일시 및 장소
일 시 : 2021년 6월 12일(토) ~ 2021년 8월 28일(토)
장 소 : 트레블로지 동대문 호텔 2층 미팅룸 (서울 중구 동호로 359)
감염병 상황에 따라 교육장소 변경가능
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원, 서울의대 정보의학실
인 원 : 30명 내외(대면 20명 내외, 비대면 10명 내외)
■ 일정별 프로그램
| 시간 | 6/12 (토) | 6/19 (토) | 6/26 (토) | 7/3 (토) | 7/10 (토) |
| 주제 | R 통계학 | R 통계학 | R 통계학 | 파이썬 | 파이썬 |
| 9:00~ 10:35 |
Starting with R | Microarray data analysis 1 | Reshaping data and Cluster |
Starting with Python | Medical informatics practice 1 |
| 10:45~ 12:15 |
Data manipulation with R |
Microarray Data Analysis II |
Evaluation and Validation | Data structure of python | Medical informatics practice 2 |
| 12:15~ 13:15 |
중 식 | ||||
| 주제 | R 통계학 | R 통계학 | R 통계학 | 파이썬 | 파이썬 |
| 13:15~ 14:50 |
Statistical Analysis I |
Classification using R |
Advanced pathway analysis | Functions of Python | Defining Class |
| 15:00~ 16:35 |
Statistical Analysis II |
Cell line Data at GDSC & CCLE |
Survival analysis | Regular expression | Python machine learning |
| 16:45~ 18:15 |
Exploratory Data Analysis | Advanced R graphics and ggplot2 |
Case study | Bioinformatics Practice | Python visualization |
| 시간 | 7/17 (토) | 7/24 (토) | 7/31 (토) | 8/7 (토) | 8/14 (토) |
| 주제 | 리눅스 프로그래밍 |
리눅스 프로그래밍 |
NGS 자료처리 | NGS 자료처리 | 엑솜 및 전장 유전체 |
| 9:00~ 10:35 |
Linux file system | Linux Permission | Germline Analysis Pipeline | PreProcessing | Germline calling |
| 10:45~ 12:15 |
Editing with VI | Linux Internet, Network |
Genome assembly practice I |
CellQC with R |
Germline filtering/ Annotation |
| 12:15~ 13:15 |
중 식 | ||||
| 주제 | 리눅스 프로그래밍 |
리눅스 프로그래밍 |
NGS 자료처리 | NGS 자료처리 | 엑솜 및 전장 유전체 |
| 13:15~ 14:50 |
Linux Shell Programming |
Linux Server | Genome assembly practice II |
PostProcessing1 | Somatic calling |
| 15:00~ 16:35 |
Linux Operation | Linux Multitasking and Cluster | Genome annotation practice | PostProcessing2 | Somatic Filtering/ Annotation |
| 16:45~ 18:15 |
Advanced Programming | Linux LVM | Evolution analysis practice | Interpretation | CNV |
| 시간 | 8/21 (토) | 8/28 (토) | |||
| 주제 | 엑솜 및 전장 유전체 |
전사체 후성유전체 |
|||
| 9:00~ 10:35 |
Cancer Genome Analysis | Non-coding RNA Analysis | |||
| 10:45~ 12:15 |
Somatic Variant Detection Gene Fusion Analysis |
RNA-Seq Gene Expression Analysis |
|||
| 12:15~ 13:15 |
중 식 | ||||
| 주제 | 엑솜 및 전장 유전체 |
전사체 후성유전체 |
|||
| 13:15~ 14:50 |
Advanced Cancer Genome Data Analysis |
Sequence-level Transcriptome Analysis |
|||
| 15:00~ 16:35 |
Somatic CNV detection | Epigenome Data Analysis | |||
| 16:45~ 18:15 |
Multiomics and Precision Medicine |
Epigenome Tools & Databases Visualization of DNA Methylation Data |
|||