[Bioinformatics] 2019년 12월, 유전체 정보분석 전문가 기본과정 I

#생물정보학 교육정보

유전체 정보분석 전문가 기본과정 I Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼 다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의 맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계 package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 12일 간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정I 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다. ■ 일시 및 장소 일 시 : 2019년 12월 2일(월) ~ 2019년 12월 17일(화) 오전 9시 ~ 오후 6시(매주 평일)                    장 소 : 서울대학교 의과대학 주 최 : 한국보건복지인력개발원 주 관 : 서울대학교병원 인 원 : 30명 등록비 : 등록비 무료 (강의교재 제공) ■ 교육대상 (1) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자 (2) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자 (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 창업 희망자 ■ 지원절차 서류 전형 및 합격자 개별 통지 원서교부 및 접수기간 : 2019. 10. 25 ~ 2019. 11. 9 제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출 사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com) 홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course9.html 지원방법 : 이메일 혹은 직접 제출 (우편 접수 불가) 합격자 발표일시 : 2019.11.15. (예정) 지원서 다운로드(한글) 지원서 다운로드(워드) ■ 실습 컴퓨터 가천홀에는 개인컴퓨터가 없으므로, 실습시 개인노트북 반드시 지참. 장 소 : 서울대 의학도서관3층 전산실습실(12/2,6,9,12,13,17),함춘회관 가천홀(12/3~5,10,11,16) 교 통 : 지하철 4호선 혜화역 3번 출구 주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다. ■ 일정별 프로그램 시간 12/2 (월) 12/3 (화) 12/4 (수) 12/5 (목) 12/6 (금) 주제 오리엔테이션 리눅스 프로그래밍 리눅스 프로그래밍 파이썬 프로그래밍 파이썬 프로그래밍 강사 김주한 (서울의대) 권영호 (서울여대) 권영호 (서울여대) 오지인 오지인 9:00~ 9:30 Introduction Linux Shell Programming Linux Server Introduction to Python Application of Python 9:40~ 11:20 Orientation 1 Linux Operation Linux Multitasking and Cluster Starting with Python Medical informatics practice 1 11:30~ 13:00 Orientation 2 Advanced Programming Linux LVM Data structre of Python Medical informatics practice 2 13:00~ 14:00 중  식  주제 리눅스 프로그래밍 리눅스 프로그래밍 리눅스 프로그래밍 파이썬 프로그래밍 파이썬 프로그래밍 강사 권영호 (서울여대) 권영호 (서울여대) 권영호 (서울여대) 오지인 오지인 14:00~ 15:10 리눅스 개요 및 설치 Linux User and Root Linux Tuning Functions of Python Defining Class 15:20~ 16:30 Linux file system Linux Permission Linux Package and Compile Regular expression Python Machine Learning 16:40~ 18:00 Editing with VI Linux Internet, Network Linux Security Bioinformatics Practice Python visualization 시간 12/9 (월) 12/10 (화) 12/11 (수) 12/12 (목) 12/13 (금) 주제 R 통계학 R 통계학 NGS 자료처리 NGS 자료처리 엑솜 및 전장 유전체 강사 김재환 (서울의대) 김재환 (서울의대) 박민영 (DNALink) 박민영 (DNALink) 신은순 (DNALink) 9:00~ 9:30 Introduction Machine learning algorithms for biomedical informatics Introduction of whole genome de novo analysis Overview Intro to Germline WGS/WES 9:40~ 11:20 Starting with R Microarray data analysis 1 k-mer analysis (estimated genome size) practice PreProcessing Germline Calling 11:30~ 13:00 Data manipulation with R Microarray data analysis 2 Genome assembly practice 1 CellQC Germline filtering/ Annotation 13:00~ 14:00 중  식  주제 R 통계학 R 통계학 NGS 자료처리 NGS 자료처리 엑솜 및 전장 유전체 강사 김재환 (서울의대) 김재환 (서울의대) 박민영 (DNALink) 박민영 (DNALink) 신은순 (DNALink) 14:00~ 15:10 Statistical analysis I Classification using R Genome assembly practice 2 PostProcessing1 Somatic calling 15:20~ 16:30 Statistical analysis II Evaluation and validation Genome annotation practice PostProcessing2 Somatic Filtering/ Annotation 16:40~ 18:00 Advanced R graphics and ggplot2 Case study Evolution analysis practice Interpretation CNV 시간 12/16 (월) 12/17 (화) 주제 전사체 후성유전체 전사체 후성유전체 강사 이승재 (DNALink) 이승재 (DNALink) 9:00~ 9:30 Intro to RNA-Seq analysis Epigenomics 소개 biomedical informatics 9:40~ 11:20 Set up Basic analysis environment Methyl seq 실습 1 11:30~ 13:00 Reference mapping to Genome Methyl seq 실습 2 13:00~ 14:00 중  식  주제 전사체 후성유전체 전사체 후성유전체 강사 이승재 (DNALink) 이승재 (DNALink) 14:00~ 15:10 Abundance estimation ChIP seq 실습 1 15:20~ 16:30 Differential expressed genes prediction ChIP seq 실습 2 16:40~ 18:00 Functional study ChIP seq 실습 2